פעילות המחלקה מתמקדת בנושאי אבטחת מזון ובשמירה על איכותו, בריאותו ובטיחותו. יעדי המחקר המרכזיים כוללים: שיפור הבטיחות המיקרוביאלית של תוצרת חקלאית מהחי ומהצומח; הקטנת פחתים של מזון מפעילות של חיידקים; מניעת נזקים לגרעינים ומזון יבש ע”י חרקי מחסן; מניעת זיהומים בתוצרת חקלאית ומזון הנגרמים ע”י פטריות עובש ורעלנים (מיקוטוקסינים); פיתוח תאים ואופטימיזציה של מצעי גידול למען קידום תעשיית החלבונים החילופיים; חקר הפוטנציאל הרפואי של מיצויים צמחיים ופיטוכימיקלים כבסיס לפיתוח מזון פונקציונאלי, תוספי תזונה ותרופות; חקלאות מדייקת של צמחי מרפא בעזרת בינה מלאכותית וטוקסיקולוגיה סביבתית.
