דרובי סמיר פרופסור מן המניין
חוקר/ת
- המכון לחקר תוצרת חקלאית ומזון
- חקר תוצרת חקלאית
- , משרד 101, מעבדה 107, המחלקה לחקר תוצרת חקלאית לאחר הקטיף,
- +972-506220618
- +972-39683615
ביוגרפיה
תחומי מחקר
פתולוגיה של תוצרת חקלאית לאחר הקטיף
טיפול בפרי הדר לאחר הקטיף
הדברה ביולוגית של גורמי מחלות לאחר הקטיף
חקר המיקרוביום של פירות וירקות לאחר הקטיף
פיתוח ויישום חומרי הדברה ירוקים להפחתת שאיריות חומרי הדברה במזון
Penicillium spp. מנגנוני פתוגניות של
השכלה
-
1977 - 1980
תואר ראשון מדעי החקלאות -האוניברסיטה העברית בירושלים
-
1980-1982
תואר שני במחלות צמחים ומיקרוביולוגיה - האוניברסיטה העברית בישושלים
-
1982-1985
תואר דוקטור במחלות צמחים ומיקרוביולוגיה - האוניברסיטה העברית בירושלים
-
1986-1987
בתר דוקטורט (Post doctorate) - University of California - Riverside, CA, US
תאור המחקר
נושאי מחקר עיקריים
הדברה ביולוגית של גורמי ריקבון בתוצרת חקלאית לפני ואחרי הקטיף
נושא השימוש בחומרי הדברה בחקלאות ממשיך להיות במוקד הדיון הציבורי והממלכתי ברוב המדינות בעולם. בעקבות המודעות הגבוהה לאיכות ובטיחות המזון בכלל ושאיריות חומרי הדברה במזון בפרט, והשפעתם השלילית ארוכות הטווח של חומרים אלה על בריאות הציבור והסביבה מתגברת הדרישה לתוצרת חקלאית טרייה ללא שאיריות של כימיקלים.
נעשים מאמצים רבים למציאת אמצעי חלופיים להגנה מפני מחוללי מחלות ומזיקים. בהקשר זה, מתבצעות במעבדתנו עבודות מחקר הבוחנות כיוונים שונים לרבות שיטות ביולוגיות וכן שימוש בחומרים טבעיים הנחשבים כלא מסוכנים לצרכן המוגדרים כללית כ- GRAS Regarded as Safe) Generally) ושהם בעלי פעילות אנטימיקרוביאלית אשר יוכלו להחליף את הכימיקלים הסינטטיים הרעילים.
במסגרת פרויקט ההדברה הביולוגית, אנו חוקרים מנגנון הפעולה של מיקואורגניזמים אנטגוניסטים (בעיקר שמרים), שיטות יישום שונות ופיתוח פורמולציות למוצרים מסחריים.
חקר המיקרוביום של תוצרת חקלאית לאחר הקטיף
מגוון רחב של מיקרואורגניזמים מאכלסים חלקים פנימיים וחיצוניים שלצמחים ובעלי חיים ומהווים את המיקרוביום המקיים יחסי גומלין רציפים ולרוב חיוביים במערכת ביולוגית מאוזנת. עם התקדמות המחקר, מתחדדת המשמעות והחשיבות של מיקרואורגניזמים בתהליכים ותופעות בעולם הטבע. בתחום המחקר הביוטכנולוגי, נעשה ניסיון לרתום את הידע שנצבר לטובת רווחת אוכלוסיית כדור הארץ ההולכת וגדלה בהתמדה.
במעבדתנו מתבצע מחקר מקיף השואף להבין תפקיד אוכלוסיות המיקרואורגניזמים (המיקרוביום) החיים על פני השטח של פירות וירקות במניעת התפתחות גורמי ריקבון של פירות וירקות לאחר הקטיף, ואפשרות השימוש במניפולציות של המיקרוביום לפיתוח טכנולוגיות חילופיות לשימוש בחומרי הדברה. המחקר כולל הבנת המבנה של הקהילות המיקרוביאליות על פירות וירקות:יש צורך לחקור המנגנון המעורב בהתהוות ודינמיקה של הקהילות המיקרוביאליות על פני השטח של הפירות וכיצד הן מושפעות על ידי יחסי הגומלין בינם לבין עצמם ובינם לבין המטבוליטים של הפירות. הבנה זאת תסייע לנו לפתח גישות חדשניות להדברה ביולוגית במטרה להפחית הפסדים בתוצרת חקלאית טרייה בצורה יעילה ובטוחה.
תחומי מחקר
- פתולוגיה של תוצרת חקלאית לאחר הקטיף
- טיפול בפרי הדר לאחר הקטיף
- הדברה ביולוגית של גורמי מחלות לאחר הקטיף
- חקר המיקרוביום של פירות וירקות לאחר הקטיף
- פיתוח ויישום חומרי הדברה ירוקים להפחתת שאיריות חומרי הדברה במזון
- Penicillium spp. מנגנוני פתוגניות של
פרסומים/מאמרים
- List of publications (Last 5 years)
- Chen, D., Li, G., Liu, J., Wisniewski, M., Droby, S., Levin, E., Huang, S. and Liu, Y. 2020. Multiple transcriptomic analyses and characterization of pathogen-related core effectors and LysM family members reveal their differential roles in fungal growth and pathogenicity in Penicillium expansum. Molecular Genetics and Genomics. 295 (6) : 1415-1429. DOI: 10.1007/s00438-020-01710-9
- Abdelfattah, A, Whitehead, S.R, Macarisin, D. Liu, J., Burchard, E., Freilich, S., Dardick, C., Droby, S., Wisniewski, M. 2020. Effect of washing, waxing and low-temperature storage on the postharvest microbiome of apple. Microorganisms. 8 (6), 1-21. DOI: 10.3390/microorganisms8060944
- Chalupowicz, D., Veltman, B., Droby, S., Eltzov, E. 2020. Evaluating the use of biosensors for monitoring of Penicillium digitatum infection in citrus fruit. Sensors and Actuators, B: Chemical 311, May 2020. DOI: 10.1016/j.snb.2020.127896
- Piombo, E, Abdelfattah, A, Danino, Y., Salim, S., Feygenberg, O., Spadaro, D., Wisniewski, M., Droby, S. 2020. Characterizing the fungal microbiome in date (Phoenix dactylifera) fruit pulp and peel from early development to harvest. Microorganisms 8 (5), May 2020. DOI: 10.3390/microorganisms8050641.
- Yeka Zhimo, V., Biasi, A., Kumar, A, Feygenberg, O., Salim, S., Vero, S., Wisniewski, M., Droby, S. 2020. Yeasts and bacterial consortia from kefir grains are effective biocontrol agents of postharvest diseases of fruits. Microorganisms 8 (3), March 2020. DOI: 10.3390/microorganisms8030428.
- Zhimo, V.Y., Kumar, A., Biasi, A., Salim, S., Feygenberg, O., Toamy, M.A., Abdelfattaah, A., Medina, S., Freilich, S., Wisniewski, M. and Droby, S., 2021. Compositional shifts in the strawberry fruit microbiome in response to near-harvest application of Metschnikowia fructicola, a yeast biocontrol agent. Postharvest Biology and Technology, 175, p.111469.
- Abdelfattah, A., Freilich, S., Bartuv, R., Zhimo, V.Y., Kumar, A., Biasi, A., Salim, S., Feygenberg, O., Burchard, E., Dardick, C. and Liu, J., 2021. Global analysis of the apple fruit microbiome: are all apples the same?. Environmental Microbiology. DOI: 10.1111/1462-2920.15469
- Solanki, M.K., Abdelfattah, A., Sadhasivam, S., Zakin, V., Wisniewski, M., Droby, S. and Sionov, E., 2021. Analysis of Stored Wheat Grain-Associated Microbiota Reveals Biocontrol Activity among Microorganisms against Mycotoxigenic Fungi. Journal of Fungi, 7(9), p.781
- Kumar, A., Zhimo, V.Y., Biasi, A., Feygenberg, O., Salim, S., Wisniewski, M. and Droby, S., 2021. Impact of packhouse treatments on the peel microbiome of mandarin fruit (cv. Orr). Postharvest Biology and Technology, 176, p.111519.
- Biasi, A., Zhimo, V.Y., Kumar, A., Abdelfattah, A., Salim, S., Feygenberg, O., Wisniewski, M. and Droby, S., 2021. Changes in the fungal community assembly of apple fruit following postharvest application of the yeast biocontrol agent Metschnikowia fructicola. Horticulturae, 7(10), p.360.
- Abdelfattah, A., Tack, A.J., Wasserman, B., Liu, J., Berg, G., Norelli, J., Droby, S. and Wisniewski, M., 2022. Evidence for host–microbiome co‐evolution in apple. New Phytologist, 234(6), pp.2088-2100
- Garello, M., Piombo, E., Prencipe, S., Schiavon, G., Berra, L., Wisniewski, M., Droby, S. and Spadaro, D., 2023. Fruit microbiome: A powerful tool to study the epidemiology of dry lenticel rot and white haze–Emerging postharvest diseases of apple. Postharvest Biology and Technology, 196, p.112163.
- Liu, J., Abdelfattah, A., Wasserman, B., Wisniewski, M., Droby, S., Fazio, G., Mazzola, M. and Wu, X., 2022. Contrasting effects of genotype and root size on the fungal and bacterial communities associated with apple rootstocks. Horticulture research, 9.
- Zhimo, V.Y., Kumar, A., Biasi, A., Abdelfattah, A., Sharma, V.K., Salim, S., Feygenberg, O., Bartuv, R., Freilich, S., Whitehead, S.R., Wisniewski, M. and Droby, S. 2022. Assembly and dynamics of the apple carposphere microbiome during fruit development and storage. Frontiers in Microbiology, 13.
- Urbaneja, A. Ciancio, A., Droby, S., Hoddle, M., Liu. and Tena, A. 2023. Recent advances in biological control of citrus pests and diseases, Biological Control, Volume 184, doi.org/10.1016/j
- Bartuv R, Berihu M, Medina S, Salim S, Feygenberg O, Faigenboim-Doron A, Zhimo VY, Abdelfattah A, Piombo E, Wisniewski M, Freilich S, Droby S. Functional analysis of the apple fruit microbiome based on shotgun metagenomic sequencing of conventional and organic orchard samples. Environ Microbiol. 2023 Sep;25(9):1728-1746. doi: 10.1111/1462-2920.16353..
- Garello, M., Piombo, E., Prencipe, S., Schiavon, G., Berra, L., Wisniewski, M. and Droby, S. Davide Spadaro, Fruit microbiome: A powerful tool to study the epidemiology of dry lenticel rot and white haze – Emerging postharvest diseases of apple, Postharvest Biology and Technology, Volume 196, 2023, 112163, ISSN 0925-5214, https://doi.org/10.1016/j.postharvbio.2022.112163.
- Guaschino M, Garello M, Nari L, Zhimo YV, Droby S and Spadaro D (2024) Soil, rhizosphere, and root microbiome in kiwifruit vine decline, an emerging multifactorial disease. Front. Microbiol. 15:1330865. doi: 10.3389/fmicb.2024.1330865
- Shu C, Sun X, Cao J, Droby S, Jiang W. Antifungal efficiency and mechanisms of ethyl ferulate against postharvest pathogens. Int J Food Microbiol. 2024 Jun 2;417:110710. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2024.110710. Epub 2024 Apr 20. PMID: 38643598.