דוקטורט - אוניברסיטת תל אביב, המחלקה למיקרוביולוגיה וביוטכנולוגיה.
אפיון טקסונומי ופונקציונלי של מיקרוביום מערכת העיכול של מעלי גירה
2014-2016
פוסט דוקטורט - אוניברסיטת קיל IKMB, גרמניה
תאור המחקר
בכרס הפרה שוכנת אוכלוסיית מיקרואורגניזמים המורכבת ממספר גדול של מינים אשר חשיבותם לפרה והאפקט שלהם על הסביבה מתבטאת באופנים רבים הכוללים התמחות בפירוק ועיכול יעיל של המזון הצמחי, בריאותה של הפרה ופליטה של פסולת וגזים לסביבה. למרות ההתקדמות בשנים האחרונות בהבנת המורכבות של התהליכים המתרחשים בכרס, והתפתחויות טכנולוגיות אשר אפשרו מבט מעמיק באוכלוסייה זו, תפקידם של חלק מקבוצות המיקרואורגניזמים בכרס אינו ברור גם כיום. חסר זה נכון במיוחד לגבי הפרוטוזואה, קבוצת תאים איוקריוטים המהווים כ-50% מהביומסה של המיקרואורגניזם בכרס. מחקרים קודמים מצביעים על כך שקבוצה זו של מיקרואורגניזמים מעורבת בתהליכים רבים הקשורים לבריאות הפרה ויכולתה להפיק אנרגיה מהמזון. בנוסף קבוצה זו חשודה במעורבותה בתהליך המתאנוגנזה המייצר גז מתאן, הידוע כגז חממה פוטנטי בעל השפעה סביבתית שלילית רבה.
לכן המעבדה שלנו מתמקדת במספר היבטים של מחקר בנוגע לפרוטוזואה, הכוללים:
הבנת הכוחות האקולוגיים המניעים את הרכב הקהילה בשלבים שונים של חיי החיה
בחינת השפעת הפרוטוזואה על המערכת האקולוגית בכרס, בדגש על אינטראקציות עם קהילת החיידקים והארכאים
בחינת ההשפעתה של אוכלוסיית פרוטוזואה על פנוטיפ החיה המארח
הבהרת תפקידה של אוכלוסיית פרוטוזואה בכרס דרך העדשות הללו תאפשר לקבל תמונה מלאה יותר של תפקידו של המיקרוביום בכרס על פיזיולוגיה של החיה, תנאי מוקדם לפיתוח גישות מונחות מיקרוביום לשיפור ביצועי המשקים ובמקביל מיגור פליטות גזי חממה ממשקי בעלי חיים.
אינטרקציה פיזית בין פרוטוזואה מסוג Isotricha עם סימביונט חיידקי